张潇教授团队在SCI期刊BMC Genomics
发表机器学习预测蛋白质修饰靶点研究论文
2020年11月,医学信息与工程学院张潇教授团队在SCI期刊BMC Genomics发表研究论文Mal-Prec: computational prediction of protein Malonylation sites via machine learning based feature integration,针对蛋白质序列的丙二酰化预测这一问题,提出基于机器学习算法的新型解决方案。BMC Genomics是JCR1区,中科院2区SCI杂志,影响因子3.594,主要关注基因组学、功能基因组学、表观基因组学、蛋白质组学和转录组学等方面新方法和新技术的研究工作。论文通讯作者为张潇教授和刘莘教授,第一作者为智能医学工程教研室刘莘教授和王亮教授,主要合作者包括徐州医科大学产业管理办公室主任胡俊峰教授,以及徐州医科大学访问学者、美国杜兰大学终身教授李剑博士。

蛋白质酰基化修饰是一类特别的蛋白质翻译后修饰,其修饰基团的供体是代谢途径的中间产物。除乙酰化修饰外,近年还鉴定出了一系列新型的酰基化修饰,包括丙酰化、丁酰化、琥珀酰化、豆蔻酰化、和丙二酰化等,但这些新型酰基化修饰对蛋白质结构与功能的调控作用尚不清楚,其与重大疾病的发生发展是否具有相关性是亟待解决的问题。

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https://bmcgenomics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12864-020-07166-w