摘要

古细菌是地球上的一组主要生命形式，可以在许多独特的环境中繁衍生息。它们对极端生态位的成功定植需要在蛋白质组学水平上进行相应的适应，以维持稳定的细胞结构和活跃的生理功能。虽然一些研究已经基于基因组特征和蛋白质结构调查了古细菌的嗜极生活方式，但缺乏大规模的比较蛋白质组学分析。在这项研究中，我们探索了来自病理系统资源集成中心 (PATRIC) 数据库的 686 个高质量古菌基因组（蛋白质组）。重新确认了基因组特征的一般模式，例如基因组大小、编码能力（编码基因和非编码区）和 G+C 含量。然后在古细菌物种中鉴定蛋白质结构域分布模式。由于其在古细菌生理功能中的重要性，研究了具有未知功能的域 (DUF) 和微型蛋白质的分布。此外，还比较了相应古菌群中蛋白质序列的稳定性、疏水性、等电点、芳香性和氨基酸组成等理化性质。观察到与极端嗜好生活方式相关的独特特征，这表明对不同极端环境的进化适应对古细菌蛋白质特征具有内在影响。综上所述，这项系统研究有助于更好地了解古细菌极端嗜极生活方式背后的机制，这将进一步有助于未来研究中古细菌适应性的实验和理论进化探索。 由 Ramaswamy H. Sarma 通讯。