摘要

在细菌中，糖原在碳和能量储存中起重要作用。它的结构最近与细菌的环境耐久性联系在一起。在细菌糖原代谢的重要基因中，glgb 编码的分支酶 GBE 在形成 α-1,6- 糖苷分支点中起着重要作用，并决定了糖原的独特分支模式。以前，对一小组 GBE 基于 n 端结构的进化分析表明，可能存在两种类型的 GBE: (1)同时具有 N1和 N2(也称为 CBM48)结构域的1型 GBE 和(2)仅具有 N2结构域的2型 GBE。本研究以隐马尔可夫模型为基础，对169个人工评价的细菌 gbe 的 n 端结构域进行了初步分析。在 N1结构域之前，我们发现了一组以前未报道的 GBEs (3型) ，其中包含了大约100个氨基酸。系统发育分析发现某些细菌门的 GBE 类型聚集，其中较短的2型 GBE 主要存在于革兰氏阳性菌中，而较长的1型 GBE 主要存在于革兰氏阴性菌中。一些体外研究已经将 N1结构域与糖原形成过程中短寡糖链的转移联系起来，从而导致小而致密的糖原结构。紧凑的糖原降解更慢，因此，可作为一个持久的能量储备，有助于增强细菌的环境持久性。因此，我们感兴趣的是通过大规模序列分析基于其 n 端域对 GBEs 进行分类。另外，我们通过种类和序列水平的系统发育分析来了解不同种类的 GBEs 的进化模式。为了进行结构比较，还对 GBE N-termini 进行了三维建模。对9,387个 GBE 序列的进一步研究发现，147个 GBE 可能属于可能是新的3型 GBE，其中大部分属于 Actinobacteria 门。我们还试图将糖原平均链长(ACL)与 GBE 类型联系起来。然而，由于数据有限，没有得出重要的结论。综上所述，本研究从结构域组织的角度对细菌 GBE 进行了系统的研究，为进一步研究 GBE 在糖原结构和细菌生理方面的 n- 末端功能提供了实验依据。

关键词: CBM48; N1结构域; 平均链长; 分支酶; 耐久性; 糖原。